ЗӘР ШЫҒАРУ ЖОЛДАРЫНЫҢ ПАТОГЕНДЕРІН ОҚШАУЛАП АЛУ ЖӘНЕ ДИФФЕРЕНЦИАЦИЯЛАУ ҮШІН CHROMAGARTM ХРОМОГЕНДІК ОРТАСЫНЫҢ БАҒЫТЫН БАҒАЛАУ

Зерттеудің мақсаты. CHROMagar™ Orientation хромогендік ортасының зәр шығару жолдарының патогендерін оқшаулау және дифференциациялау бағытын бағалау.
Материалдар және әдістер. 2019 жылы Қарағандыда (Қазақстан) ЖЖИ клиникалық күдігі бар пациенттерден алынған зәрдің 147 үлгісі бойынша перспективалық зерттеу жүргізілді. Болжалды микроорганизмдерді анықтау хромагенді бағыттау бойынша морфологиясына, колониялардың түсіне және өндіруші ұсынған сипаттамаларға сәйкес жүргізілді. Түріне сәйкес изоляттарды түпкілікті анықтау Microflex LT жүйесін және MALDI Biotyper Compass v.4.1.80 (Bruker Daltonics, Германия) бағдарламалық құралын пайдалана отырып, лазерлік десорбциялық-иондалу–ұшу уақыты масс-спектрометриясы (MALDI-TOF MS) арқылы жүргізілді. Ұсынылған ≥2,0 балл мәндері түрлерді сенімді сәйкестендіру критерийі ретінде пайдаланылды.
Нәтижелер және талқылау. 147 зәр үлгілерінде 55-і (37,4%) бактериялардың өсуіне оң нәтиже көрсетті, 86сы (58,5%) өспеді, 6 үлгі ластанған материал ретінде қарастырылды. Мәлімделген микроорганизмдерді анықтау үшін CHROMagar™ Orientation қолданудың салыстырмалы нәтижелері масс-спектрометриямен салыстырғанда сезімталдық пен ерекшеліктің 100%-ға жеткенін көрсетті. E. coli үшін өте жақсы түрлік идентификациясын көрсетті колониялар қою қызғылт түске боялады, бірақ қалған микроорганизмдер үшін кейбір шектеулер бар сәйкесінше Klebsiella, Enterobacter, Citrobacter, Serratia, мұндай жағдайларда қосымша сынақтармен қосымша түр идентификациясы қажет болады.
Қорытынды. Зерттеу нәтижелері CHROMagar™ Orientation хромогендік бағдарлау ортасын зәр шығару жолдарының микроорганизмдерін оқшаулау және дифференциациялау үшін пайдалануға болатынын көрсетті. Бұл тиісті уропатогендерді сенімді идентификациялауды, дифференциациялауды, уақыт пен зерттеу шығындарын үнемдеуді қамтамасыз етеді. 

1. Палагин И.С., Сухорукова М.В., Дехнич А.В. .Антибиотикорезистентность возбудителей внебольничных инфекций мочевых путей в России: результаты многоцентрового исследования «ДАРМИС-2018». Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2019; 21 (2): 134 -146.

2. Шипицына Е.В., Хуснутдинова Т.А., Савичева А.М. Инфекции мочевыводящих путей в акушерстве и гинекологии. Журнал акушерства и женских болезней. 2015; 6: 91-104.

3. Prasad M., Shetty S.K., Nair B.G. A novel and improved selective media for the isolation and enumeration of Klebsiella species. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2022; 106 (24): 8273-8284.

4. Shah K.J., Cherabuddi K., Shultz J., Borgert S., Ramphal R., Klinker K.P. Ampicillin for the treatment of complicated urinary tract infections caused by vancomycin-resistant Enterococcus spp (VRE): a single-center university hospital experience. Int. J. Antimicrob Agents. 2018; 51 (1): 57-61.

5. Akter L., Haque R., Salam M.A.Comparative evaluation of chromogenic agar medium and conventional culture system for isolation and presumptive identification of uropathogens. J. Med. Sci. 2014; 30 (5): 1033-1041.

6. Skulnick M., Mitchell B., Mazzulli T. Cost Effectiveness of BBL™ CHROMagar™ Orientation Medium for Routine Urine Cultures. American Society for Microbiology. 2004; 6: 323-329.

7. Dickson K., Zhou J., Lehmann C. Lower. Lower Urinary Tract Inflammation and Infection: Key Microbiological and Immunological Aspects. J. Clin. Med. 2024; 13 (2): 315.

8. Mulet B.J.V., Salvador G.C., Tormo P.N. Novel Chromogenic Medium CHROMagarTM Candida Plus for Detection of Candida auris and Other Candida Species from Surveillance and Environmental Samples: A Multicenter Study. J. Fungi. (Basel). 2022; 8 (3): 281.

9. Smit C.C.H., Lambert M., Rogers K. One Health Determinants of Escherichia coli Antimicrobial Resistance in Humans in the Community: An Umbrella Review. Int. J. Mol. Sci. 2023; 24: 17204.

10. Patel R. MALDI-TOF MS for the diagnosis of infectious diseases. Clin. Chem. 2015; 61 (1): 100-111.

11. Desai D.J., Gilbert B., McBride C.A. Paediatric urinary tract infections: Diagnosis and treatment. Aust. Fam. Physician. 2016; 45 (8): 558-563.

12. Perry J.D. A Decade of Development of Chromogenic Culture Media for Clinical Microbiology in an Era of Molecular Diagnostics. Clin. Microbiol. Rev. 2017; 30 (2): 449-479.

13. Robberts F.J.L., Owusu-Ofori A., Oduro G. Rapid, Low-Complexity, Simultaneous Bacterial Group Identification and Antimicrobial Susceptibility Testing Performed Directly on Positive Blood Culture Bottles Using Chromogenic Agar. Am. J. Trop. Med. Hyg. 2022; 107 (6): 1302-1307.

14. Aydin A., Ahmed K., Zaman I. Recurrent urinary tract infections in women. Int. Urogynecol. J. 2015; 26 (6): 795-804.

15. Kodner C.M., Gupton T. Recurrent urinary tract infections in women: diagnosis and management. Am. Fam. Physician. 2010; 82 (6): 638-643.

16. Stefaniuk E.M. The Usefulness of Chromogenic Media for Qualitative and Semi-Quantitative Diagnostic of Urinary Tract Infections. Pol. J. Microbiol. 2018; 67 (2): 213-218.

17. Foroogh N., Rezvan M., Ahmad K., Mahmood S. Structural and functional characterization of the FimH adhesin of uropathogenic Escherichia coli and its novel applications. Microb. Pathog. 2021; 161: 105288.

18. Gupta K., Grigoryan L., Trautner B. Urinary Tract Infection. Ann. Intern. Med. 2017; 167 (7): 2017 Oct 3;167 (7): ITC49-ITC64.

19. Sharmin S., Alamgir F., Begum F. Use of Chromogenic Agar Media for Identification of Uropathogen. Bangladesh J. Med. Microbiol. 2010; 4 (1): 18-23.