Оценка хромогенной среды CHROMagar™ orientation для изоляции и дифференцирования патогенных микроорганизмов мочевыводящих путей

Цель исследования. Оценка хромогенной среды CHROMagar™ Orientation для изоляции и дифференцирования патогенных микроорганизмов мочевыводящих.
Материалы и методы. Было проведено проспективное исследование, в которое были включены 147 последовательных образцов мочи, взятых у пациентов с клиническим подозрением на инфекции мочевыводящих путей в г. Караганде (Республика Казахстан) в 2019 г.
Идентификацию микроорганизмов проводили на среде CHROMagar™ Orientation в соответствии с морфологией, цветом колоний и характеристиками, рекомендованными производителем. Окончательную идентификацию изолятов до вида осуществляли с помощью лазерной десорбционно-ионизационно-времяпролетной масс-спектрометрии (MALDI-TOF MS) с использованием системы Microflex LT и программного обеспечения MALDI Biotyper Compass v.4.1.80 (Bruker Daltonics, Германия). Рекомендуемые значения балла ≥2,0 были использованы в качестве критерия для надежной идентификации видов.
Результаты и обсуждение. 55 (37,4%) из 147 посевов мочи дали положительный результат на рост бактерий, 86 (58,5%) не дали роста, 6 образцов были расценены как контаминированный материал. Сравнительные результаты применения CHROMagar™ Orientation для идентификации заявленных микроорганизмов достигли 100% чувствительности и специфичности в сравнении с масс-спектрометрией. Зарегистрирован отличная видовая идентификация для E. сoli – колонии окрашивались в темно-розовый цвет, но для остальных микроорганизмом этого порядка имелись некоторые ограничения – в случае с Klebsiella, Enterobacter, Citrobacter и Serratia необходима дальнейшая видовая идентификация дополнительными тестами.
Выводы. Среда CHROMagar™ Orientation может быть использована для выделения и дифференциации микроорганизмов мочевыводящих путей, что обеспечит надежную идентификацию соответствующих уропатогенов, дифференциацию культур, экономию времени и затрат на исследования. 

1. Палагин И.С., Сухорукова М.В., Дехнич А.В. .Антибиотикорезистентность возбудителей внебольничных инфекций мочевых путей в России: результаты многоцентрового исследования «ДАРМИС-2018». Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2019; 21 (2): 134 -146.

2. Шипицына Е.В., Хуснутдинова Т.А., Савичева А.М. Инфекции мочевыводящих путей в акушерстве и гинекологии. Журнал акушерства и женских болезней. 2015; 6: 91-104.

3. Prasad M., Shetty S.K., Nair B.G. A novel and improved selective media for the isolation and enumeration of Klebsiella species. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2022; 106 (24): 8273-8284.

4. Shah K.J., Cherabuddi K., Shultz J., Borgert S., Ramphal R., Klinker K.P. Ampicillin for the treatment of complicated urinary tract infections caused by vancomycin-resistant Enterococcus spp (VRE): a single-center university hospital experience. Int. J. Antimicrob Agents. 2018; 51 (1): 57-61.

5. Akter L., Haque R., Salam M.A.Comparative evaluation of chromogenic agar medium and conventional culture system for isolation and presumptive identification of uropathogens. J. Med. Sci. 2014; 30 (5): 1033-1041.

6. Skulnick M., Mitchell B., Mazzulli T. Cost Effectiveness of BBL™ CHROMagar™ Orientation Medium for Routine Urine Cultures. American Society for Microbiology. 2004; 6: 323-329.

7. Dickson K., Zhou J., Lehmann C. Lower. Lower Urinary Tract Inflammation and Infection: Key Microbiological and Immunological Aspects. J. Clin. Med. 2024; 13 (2): 315.

8. Mulet B.J.V., Salvador G.C., Tormo P.N. Novel Chromogenic Medium CHROMagarTM Candida Plus for Detection of Candida auris and Other Candida Species from Surveillance and Environmental Samples: A Multicenter Study. J. Fungi. (Basel). 2022; 8 (3): 281.

9. Smit C.C.H., Lambert M., Rogers K. One Health Determinants of Escherichia coli Antimicrobial Resistance in Humans in the Community: An Umbrella Review. Int. J. Mol. Sci. 2023; 24: 17204.

10. Patel R. MALDI-TOF MS for the diagnosis of infectious diseases. Clin. Chem. 2015; 61 (1): 100-111.

11. Desai D.J., Gilbert B., McBride C.A. Paediatric urinary tract infections: Diagnosis and treatment. Aust. Fam. Physician. 2016; 45 (8): 558-563.

12. Perry J.D. A Decade of Development of Chromogenic Culture Media for Clinical Microbiology in an Era of Molecular Diagnostics. Clin. Microbiol. Rev. 2017; 30 (2): 449-479.

13. Robberts F.J.L., Owusu-Ofori A., Oduro G. Rapid, Low-Complexity, Simultaneous Bacterial Group Identification and Antimicrobial Susceptibility Testing Performed Directly on Positive Blood Culture Bottles Using Chromogenic Agar. Am. J. Trop. Med. Hyg. 2022; 107 (6): 1302-1307.

14. Aydin A., Ahmed K., Zaman I. Recurrent urinary tract infections in women. Int. Urogynecol. J. 2015; 26 (6): 795-804.

15. Kodner C.M., Gupton T. Recurrent urinary tract infections in women: diagnosis and management. Am. Fam. Physician. 2010; 82 (6): 638-643.

16. Stefaniuk E.M. The Usefulness of Chromogenic Media for Qualitative and Semi-Quantitative Diagnostic of Urinary Tract Infections. Pol. J. Microbiol. 2018; 67 (2): 213-218.

17. Foroogh N., Rezvan M., Ahmad K., Mahmood S. Structural and functional characterization of the FimH adhesin of uropathogenic Escherichia coli and its novel applications. Microb. Pathog. 2021; 161: 105288.

18. Gupta K., Grigoryan L., Trautner B. Urinary Tract Infection. Ann. Intern. Med. 2017; 167 (7): 2017 Oct 3;167 (7): ITC49-ITC64.

19. Sharmin S., Alamgir F., Begum F. Use of Chromogenic Agar Media for Identification of Uropathogen. Bangladesh J. Med. Microbiol. 2010; 4 (1): 18-23.